薛城遗址是南京地区已知面积最大、时代最早的重要史前聚落遗址。为1997年薛城乡卫生院在新建办公大楼工程施工中发现，距今5000—6300年。在考古发掘之初，《人民日报》曾以《南京远祖在薛城》为题进行报道，并被评为1997年全国十大考古新发现提名荣誉奖。2021年发现的“龙形”蚬壳堆塑遗迹，则被有关学者称为“江南第一龙”。2023年10月7日、8日，中央电视台科教频道《探索·发现》栏目连续两天播出《解密薛城》纪录片，用镜头阐释薛城遗址独特的文化面貌。

薛城遗址持续多年的考古发掘和多学科综合研究，填补了长江下游南岸古丹阳湖地区史前考古的空白，是南京乃至江苏地域文明探源的关键遗址之一，对构筑这一地区史前文化发展序列，对探讨长江下游地区早期文明化进程都具有极其重要的学术价值。